Akropolis' historie går tilbage til den neolitiske periode (ca. 4.000 f.v.t.), men det var i løbet af bronzealderen (ca. 2.000 f.v.t.), at stedet begyndte at få større betydning. Tidlige mykenske bosættelser, som fandtes på Akropolis, tyder på, at området blev betragtet som helligt, selv før det klassiske Athen opstod. De første større bygninger på Akropolis stammer fra denne periode.